Improved access to arachnological data for ecological research through the ARAMOB data repository, supported by Diversity Workbench and NFDI data pipelines

The scientific community has been developing and refining digital data standards to ensure that biodiversity data can be easily exchanged between different databases, systems and institutions. However, scientists still face the challenge of effectively analysing this vast amount of data. Variations in the quality, documentation and availability of metadata often make it difficult for scientists to compile appropriate datasets for their research. One contribution towards this task is the research data repository ARAMOB of the Arachnologische Gesellschaft (AraGes), which focuses on systematically collected data on spider assemblages. Mandatory requirements have been developed to ensure the quality and utility of the data for ecological research during a given project. A next step towards enhancing the data basis for convincing analyses of spider assemblages in Central Europe is the offer to now publish data in the society’s open access journal Arachnologische Mitteilungen/Arachnology Letters, which are integrated into the data repository and thus made effectively accessible and usable. These data papers will be presented as one printed page in the journal, accessible on the website of the AraGes and from the BioOne Digital Library, accompanied by a PDF-document containing metadata to effectively use the published data. The original dataset is published as spreadsheet tables, but also deposited in the ARAMOB data repository, which is managed with the modularized database software and virtual research environment Diversity Workbench. By this means, the published data packages are also accessible and analysable within a wider context through the ARAMOB web portal. On request, scientists can also exploit data with the free and well-documented Diversity Workbench software tools. The data pipelines involved are defined in the context of the National Research Data Infrastructure (NFDI).

Mit Beginn des digitalen Zeitalters haben Wissenschaftler Datenstandards entwickelt und verfeinert, um sicherzustellen, dass Biodiversitätsdaten zwischen verschiedenen Datenbanken, Systemen und Institutionen ausgetauscht werden können. Es stellt jedoch immer noch eine Herausforderung dar, umfangreiche Datenmengen aus verschiedenen Quellen aufzunehmen und für effektive Analysen in Datenspeicher zu übertragen. Unterschiede in der Qualität und Dokumentation (Verfügbarkeit von Metadaten) erschweren es Wissenschaftlern häufig, geeignete Datensätze für ihre Auswertungen zusammenzustellen. Einen Beitrag zu dieser Aufgabe leistet das Forschungsdatenrepositorium ARAMOB der Arachnologischen Gesellschaft (AraGes), das sich auf systematisch erhobene Daten zu Spinnenzönosen konzentriert. Verbindliche Anforderungen zur Sicherstellung von Qualität und Nutzbarkeit der Daten für ökologische Forschung wurden in einem vorausgegangenen Projekt formuliert. Ein nächster Schritt, um die Datenbasis für fundierte Analysen von Spinnenzönosen in Mitteleuropa zu verbessern, ist nun das Angebot der Publikation von Daten in der frei zugänglichen Vereinszeitschrift Arachnologische Mitteilungen/Arachnology Letters, die in das Datenrepositorium integriert und damit effektiv zugänglich und nutzbar gemacht werden. Die als data paper veröffentlichten Daten werden auf einer Druckseite der Zeitschrift präsentiert, die auf den AraGes Webseiten und in der BioOne Digital Library öffentlich zugänglich ist. Dieser Artikel wird von einem zweiten PDF-Dokument, das die Metadaten zur effektiven Nutzung der veröffentlichten Daten enthält, sowie den Originaldaten in Tabellenform ergänzt. Die Daten werden im ARAMOB Datenrepositorium hinterlegt, das mit der modularen Datenbanksoftware und virtuellen Forschungsumgebung Diversity Workbench gemanagt wird. Über das ARAMOB-Webportal sind die veröffentlichten Datenpakete somit auch in einem breiteren Kontext zugänglich und analysierbar. Mitglieder der AraGes können darüber hinaus Daten mit den frei verfügbaren und gut dokumentierten Diversity Workbench Software-Tools erschließen. Die beteiligten Datenpipelines sind im Kontext der Initiative der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) definiert.